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夏志强
2020年10月15日 12:02  点击:

 

夏志强,2016-2017年美国加州大学戴维斯分校访问学者,硕士生导师,曾担任中国热带农业科学院热带生物组学大数据中心副主任,海南省南海青年名家,中国民族医药协会黎医药分会理事,热区石漠化山地绿色高效农业科技新联盟理事。近10年来一直从事基因组,重测序,转录组和高通量技术开发等研究,在生物信息学,分子育种技术方法领域广泛涉猎和较丰富的研究经验。建立了高通量多组学图谱和高性能生物信息技术为基础的技术平台。在热带生物组学大数据中心,执行开发了多维度组学创新平台,提供一个全新的在染色体层面上的基因组、甲基化、转录组的大数据分析体系。不断开发新的实验技术和大数据算法。原创研发两代超低成本基因型分型技术和表观遗传分析技术,现已成功用于约20个物种研究中,已申报国家发明专利四项,荣获国家发明专利授权一项。在Nucleic Acids Research、Biotechnol Biofuels,Nature、Nature Communications等SCI杂志发表具有影响力的学术论文,累积影响因子158.4,其中第一作者或通讯作者17篇,累积影响因子约66.4。担任2项国家重点研发项目专题负责人,主持和参加国家自然科学基金、重点基金、科技部973项目、国家木薯产业体系等科研项目10余项。


一、基本信息

姓名: 夏志强

性别: 男

出生年月: 1982年10月

民族: 汉

学位: 博士

职称: 副研究员

开设课程:生物信息学,南繁育种

主要研究方向:基因组与大数据育种

博士研究生招生方向:作物遗传育种

硕士研究生招生方向:作物学\农艺与种业\资源利用与植物保护


二、联系方式

办公电话:13637691088

手机:13637691088

E-mail: zqiangx@gmail.com


三、教育经历

2016.01-2017.11美国 加州大学戴维斯分校UCDavis访问学者/生物信息学

2012.09-2018.12中国 华中农业大学 作物遗传育种 博士

2005.09-2008.06中国 海南大学 种质资源学 硕士

2001.09-2005.06中国 华南热带农业大学 生物技术 学士


四、科研与学术工作经历

2020.07-至今 中国 海南大学 副研究员

2018.01-2020.07 中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 副研究员

2013.01-2017.12 中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 助理研究员

2008.12-2012.12 中国 中国热带农业科学院热带生物技术研究所 研究实习员


五、科研项目

1.国家重点研发计划项目,2019YFD1000500,热带作物种质资源精准评价与基因发掘,2019.01-2022.12,120万,在研,专题负责人

2.国家重点研发计划项目,2019YFD1001100,热带作物高效育种技术与品种创制,2019.01-2022.12,200万,在研,专题负责人

3.滇桂黔石漠化地区特色作物产业发展关键技术集成示范项目,SMH2019-2021,石漠化地区特色作物指纹图谱开发,2019.01-2022.12,60万,在研,主持

4.国家自然科学基金青年基金项目,31301102,基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性(AFSM),2014.01-2016.12,23万元,已结题,主持

5.2016年中国家留学基金管理委员会资助项目,2016.10-2017.11,14万,已结题,主持

6.海南省自然科学基金面上项目,,木薯干旱胁迫DNA甲基化变化及其相关代谢途径的响应,2016.01-2017.12,10万元,已结题,主持

7.国家重点基础研究发展规划(973)项目:,2010CB126601,木薯淀粉高效累积途径及其关键基因,2010.01-2014.12,562万元,已结题,主要参加人

8.科技部国际合作重点项目,2011DFB31690,中南美洲热带作物种质收集与共同研究,2011.01-2014.12,525万,已结题,主要参加人

9.国家自然科学基金面上项目,31171230,木薯SNP遗传图谱构建与抗寒性QTL精细定位,2012.01-2015.12,60万元,已结题,主要参加人

10.国家自然科学基金NSFC-CG国际合作重点项目,31261140363,木薯全基因组关联分析与分子设计育种模型,2013.01-2017.12,239万元,已结题,主要参加人

11.科技部常规性科技援助项目,KY201701005,热带作物基因组学与种质创新联合实验室,2018.01-2020.12,180万元,在研,主要参加人

12.国家自然科学基金地区科学基金项目,C130410,西南地区薏苡种质资源遗传多样性分析和核心种质库构建,2016.01-2019.12,53.868万元,在研,主要参加人

13.国家自然科学基金地区科学基金项目,31660417,基于AFSM技术的马铃薯晚疫病抗性全基因组关联分析,2017.01-2020.12,39万元,在研,主要参加人

14.国家自然科学基金地区科学基金项目,31660418,甘蔗蔗糖分性状的关联分析及优益基因资源发掘,2017.01-2020.12,43万元,在研,主要参加人


六、代表性成果

(一)论文

1.  Xia Z, Zou M, Zhang S, Feng B, Wang W. AFSM sequencing approach: a simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site discovery and genetic mapping. Scientific Reports, 2014, 4: 7300. (SCI收录,IF:5.578,第一作者)

2. Gu J#,Xia Z#, Luo Y, Jiang X, Qian B, Xie H, Zhu J, Xiong L, Zhu J, Wang Z. Spliceosomal protein U1A is involved in alternative splicing and salt stress tolerance inArabidopsis thaliana. Nucleic Acids Res, 2018, 46(4):1777-1792.(SCI收录,IF:11.561,第一作者)

3. Xia Z, Zhang S, Wen M, Lu C, Sun Y, Zou M, Wang W. Construction of an ultrahigh-density genetic linkage map forJatropha curcas L. and identification of QTL for fruit yield. Biotechnol Biofuels, 2018, 11:3(SCI收录,IF:5.497,第一作者)

4. Xia Z, Liu K, Zhang S, Yu W, Zou M, He L, Wang W. An ultra-high density map allowed for mapping QTL and candidate genes controlling dry latex yield in rubber tree. Industrial Crops and Products, 2018, 120:351-356. (SCI收录,IF:3.849,第一作者)

5. Wang W#, Feng B#, Xiao J#,Xia Z, Zhao X, Li P, Zhang W, Wang Y, Moller B, Liu B, Li K, Peng M. Cassava genome from a wild ancestor to cultivated varieties. Nature Communications 2014, 5:5110(SCI收录,IF:11.470,第二作者)

6. Hu W#,Xia Z#, Yan Y, Ding Z, Tie W, Wang L, Zou M, Wei Y, Lu C, Hou X, Wang W, Peng M. Genome-wide gene phylogeny of CIPK family in cassava and expression analysis of partial drought-induced genes. Frontiers in plant science 2015, 6: 914.(SCI收录,IF:4.495,第一作者)

7. Wei Y#, Shi H#,Xia Z#, Tie W, Ding Z, Yan Y, Wang W, Hu W, Li K. Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the WRKY Gene Family in Cassava. Frontiers in plant science 2016, 7, 25:1-18(SCI收录,IF:4.291,第一作者)

8. Zou M, Lu C, Zhang S, Chen Q, Sun X, Ma P,Xia Z*, Wang W*. Epigenetic map and genetic map basis of complex traits in cassava population. Scientific Reports. 2017, 7: 41232. (SCI收录,IF:4.259,通讯作者)

9. Shengkui Zhang(#),Zhiqiang Xia(#), Wenqing Zhang, Can Li, Xiaohan Wang, Xianqin Lu, Xianyan Zhao, Haizhen Ma, Xincheng Zhou, Weixiong Zhang, Tingting Zhu, Pandao Liu, Guodao Liu, Hubiao Yang, Jacobo Arango, Michael Peters, Wenquan Wang, Tao Xia Chromosome-Scale Genome Assembly Provides Insights into Speciation of Allotetraploid and Massive Biomass Accumulation of Elephant Grass (Pennisetum purpureum Schum.) bioRxiv,2020 doi: https://doi.org/10.1101/2020.02.28.970749(第一作者)

10. Congshan Xu 1,†,Zhiqiang Xia2,†, Zhiqiang Huang 3, Chao Xia 4, Jing Huang 1, Manrong Zha 5, Shujuan Wang 1, Muhammad Imran 1,6, Shaun Casteel 1, Yiwei Jiang 1, Cankui Zhang 1,7,*Understanding the Physiological and Transcriptional Mechanism of Reproductive Stage Soybean in Response to Heat Stress 2020 Crop Breed Genet Genom 2020;2(1):e200004.

11. Luo M, Gu Y, Puiu D, Wang H, Twardziok S, Deal K, Huo N, Zhu T, Wang L, Wang Y, McGuire P, Liu S, Long H, Ramasamy R, Rodriguez J, Van S, Yuan L, Wang Z,Xia Z, Xia L, Anderson O, Ouyang S, Liang Y, Zimin A, Pertea G, Salzberg S, Devos K, Dvorak J. Genome sequence of the progenitor of the wheat D genomeAegilops tauschii.Nature, 2017, 551:7681. (SCI收录,IF:41.577)

12. Liu J#,Xia Z#, Tian X#, Li Y. Transcriptome sequencing and analysis of rubber tree (Hevea brasiliensis Muell.) to discover putative genes associated with tapping panel dryness (TPD). BMC Genomics 2015,16:398. (SCI收录,IF:3.867,第一作者)

13. Hao C#,Xia Z#, Fan R, Tan L, Hu L, Wu B, Wu H. De novo transcriptome sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) and an analysis of genes involved in phenylpropanoid metabolism in response to Phytophthora capsici. BMC Genomics 2016, 17: 822. (SCI收录,IF:3.729, 第一作者)

14. Zhang S, Chen X, Lu C, Ye J, Zou M, Lu K, Feng S, Pei J, Liu C, Zhou X, Ma P, Li Z, Liu C, Liao Q,Xia Z*, Wang W*. Genome-Wide Association Studies of 11 Agronomic Traits in Cassava (Manihot esculenta Crantz). Frontiers in Plant Science, 2018, 9:503. (SCI收录,IF:3.678,通讯作者)

15. Hu W#, Wei Y#,Xia Z#, Yan Y, Hou X, Zou M, Lu C, Wang W, Peng M. Genome-wide identification and expression analysis of the NAC transcription factor family in cassava. PloS one 2015, 10(8): e0136993.(SCI收录,IF:3.057,第一作者)

16. Hu W#, Hou X#,Xia Z#, Yan Y, Wei Y, Wang L, Zou M, Lu C, Wang W, Peng M. Genome-wide survey and expression analysis of the calcium-dependent protein kinase gene family in cassava. Molecular Genetics and Genomics 2016, 291(1):241-253.(SCI收录,IF:2.979,第一作者)

17. Zou M#,Xia Z#, Ling P, Zhang Y, Chen X, Wei Z, Bo W, Wang W. Mining EST-Derived SSR Markers to Assess Genetic Diversity in Cassava (Manihot esculenta Crantz). Plant Mol Biol Rep, 2011, 29:961-971 (SCI,IF:2.153, 第一作者)

18. Tang Y#, Xia Z#, Ding Z#, Ding Y, Liu Z, Ma X, Liu J. Construction of a high-density linkage map and QTL mapping for important agronomic traits inStylosanthes guianensis (Aubl.)Sw. Scientific Reports, 2019, 9:3834.(影响因子:4.36,第一作者)

19. Zou M#, Xia Z#, Lu C, Wang H, Ji J, Wang W. Genetic Diversity and Differentiation ofAquilaria sinensis (Lour.) Gilg Revealed by ISSR and SRAP Markers. CROP SCIENCE, 2012, 52(5):2304-2313 (SCI,IF:1.513, 第一作者)

20. Chen X#,Xia Z#, Fu Y, Lu C, Wang W. Constructing a genetic linkage map using an F-1 population of non-inbred parents in Cassava (Manihot esculenta Crantz). Plant Mol Biol Reporter 2010, 28:676-683 (SCI,IF:0.825, 第一作者)

21. Yang C#,Xia Z#, Hu J, Zhuang Y, Pan Y, Liu J. Transcriptome analysis ofOncidium petals provides new insights into the initiation of petal senescence. Journal of Horticultural Science and Biotechnology, 2018, 94(1):1-12.(影响因子:0.715,第一作者)

22. Chen X, Xia J,Xia Z, Zhang H, Zeng C, Lu C, Zhang W, Wang W. Potential functions of microRNAs in starch metabolism and development revealed by miRNA transcriptome profiling of cassava cultivars and their wild progenitor. BMC Plant Biology 2015, 15:33(SCI,IF:3.930)

23. Ye J, Yang H, Shi H, Wei Y, Tie W, Ding Z, Yan Y, Luo Y,Xia Z, Wang W, Peng M, Li K, Zhang H, Hu W. The MAPKKK gene family in cassava: Genome-wide identification and expression analysis against drought stress. Scientific reports 2017, 7: 14939.(影响因子:4.259)

24. Ma P#, Chen X#, Liu C,Xia Z, Song Y, Zeng C, Li Y, Wang W. MePHD1 as a PHD-Finger protein negatively regulates ADP-Glucose pyrophosphorylase small subunit1a gene in cassava. International Journal of Molecular Sciences 2018, 19: 2831.

25. Shang S#, Wu C#, Huang C#, Tie W, Yan Y, Ding Z,Xia Z, Wang W, Peng M, Tian L, Hu W. Genome-Wide Analysis of the GRF Family Reveals Their Involvement in Abiotic Stress Response in Cassava. Genes 2018, 9: 110.(影响因子:3.49)

26. Hu W, Yan Y, Tie W, Ding Z, Wu C, Ding X, Wang W,Xia Z, Guo J, Peng M. Genome-Wide Analyses of Calcium Sensors Reveal Their Involvement in Drought Stress Response and Storage Roots Deterioration after Harvest in Cassava. Genes, 2018, 9: 221.(影响因子:3.49)

27. Ou W#, Mao X#, Huang C#, Tie W, Yan Y, Ding Z, Wu C,Xia Z, Wang W, Zhou S, Li K, Hu W. Genome-Wide Identification and Expression Analysis of the KUP Family under Abiotic Stress in Cassava (Manihot esculenta Crantz). Frontiers in Physiology. 2018; 9: 17.(影响因子:3.66)

28. Hu M, Hu W,Xia Z, Zhou X, Wang W. Validation of Reference Genes for Relative Quantitative Gene Expression Studies in Cassava (Manihot esculenta Crantz) by Using Quantitative Real-Time PCR. Frontiers in plant science 2016, 7:680(SCI,IF:3.678)

29. Ma P#, Chen X#, Liu C, Meng Y,Xia Z, Zeng C, Lu C, Wang W. MeSAUR1, encoded by a small auxin-up RNA gene, acts as a transcription regulator to positively regulate ADP-glucose pyrophosphorylase small subunit1a gene in cassava. Frontiers in Plant Science 2017, 8:1315.

30. Xu C#, Xia C#,Xia Z, Zhou X, Huang J, Huang Z, Liu Y, Jiang Y, Casteel S, Zhang C. Physiological and transcriptomic responses of reproductive stage soybean to drought stress. Plant Cell Reports 2018, 37:1611-1624.

31. Pei J, Wang H,Xia Z, Liu C, Chen X, Ma P, Lu C, Wang W. Phylogeny and expression pattern of starch branching enzyme family genes in cassava (Manihot esculenta Crantz) under diverse environments. Molecular and Cellular Biochemistry 2015, 406 (1): 273-284(SCI,IF:2.561)

(二)授权专利

1.基因组随机扩增序列SNP多态性及甲基化多态性(AFSM)201410154134.9

2.一种胞嘧啶甲基化挖掘的方法201611198974.0

3.一种全基因组高效基因区富集测序方法201611199575.6

(三)教学及人才培养

1.2018年指导的博士生张三获国家奖学金(或省级优秀论文)

(四)获得奖励

1.2015年海南省科技进步一等奖:木薯比较基因组及光合产物高效积累机理

2.2016-2017年度神农中华农业科技奖二等奖:木薯全基因组测序及育种基础

3.2016年世界块根块茎作物大会(World Congress On Root And Tuber Crops)大会Poster一等奖

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