研究中心实行理事会领导下的中心主任负责制。

一、理事会

理事长：前驻外使领馆和国际组织等的主要负责人

副理事长及成员：海南大学负责同志、国内外专家学者代表（领域内重要影响的专家学者2名以上）、离退休驻外人员、特邀代表等

秘书长：杨云升教授  海南大学国际文化交流学院院长

二、执行机构

主任：杨云升教授  海南大学国际文化交流学院院长

副主任：中青年骨干教师兼任

下设5个研究所和1个 综合办公室

1. 柬埔寨研究所；2.老挝研究所；3.缅甸研究所；4.泰国研究所；5.越南研究所；6.综合研究所；7.综合办公室（配备专职人员，主要负责行政办公、信息资料、社会服务等）